· KLDP.org · KLDP.net · KLDP Wiki · KLDP BBS ·
sukdo

sukdo

고석하 (Seokha Ko)

2008-04-01

오전 : 바이오인포메틱스 숙제 완료 오후 : GO펑션 30회에서 100회 사이에 sage 데이터를 이용하여 분석 시작
R function 을 작성해서 한꺼번에 하도록,,
저녁 : 패턴인식 공부
낮에 작성한 R function 결과를 본 후 GO-BP to predict.txt 에서 30에서 100회 사이의 GO펑션 을 읽어오는데 문제가
있는 것 발견 수정중,

내일이나 되어야 sage데이터만 가지고 분석한 결과를 볼텐데,,,

pfam 데이터에 대한 내적해서 구하는것도 어서 해봐야하는데,,,음,

2008-04-02

패턴인식, 바이오인포메틱스 복습

바이오인포메틱스 퀴즈 문제 다시 풀어보기,

금요일 미팅 준비
벡터 내적 개념을 잘못 이해한 것 같다. pfam을 가지고 1인 gene을 pfam 에 각각 내적하여 average를 취한것을 feature1로, 0인 gene을 pfam 에 각각 내적하여 average한것 을 feature2로 한다.

2008-04-04

1. 미팅,
pfam 데이터를 svm으로 분석할때 threshold의 문제로 인해 -1 데이터를 전부 1로 인식 로지스틱 회귀를 이용해 분석해 볼 것,

2. 밀린 학과 공부

2008-04-05


이번주에 한 일,
  1. 각 과목 복습,
  2. pfam 데이터를 hhsvm 으로 분석
    (GO function 을 protein의 domain을 이용해 분석)

이번 주 할일

- 바이오인포메틱스 과제 - 패턴인식 과제 - 각 과목 예습 및 복습 - 로지스틱 회귀 분석 공부 및 pfam 데이터 이용해서 해보기 - 운동 시작

4/6

이번 주 할일

- 바이오인포메틱스 과제 - 패턴인식 과제 - 각 과목 예습 및 복습 - 로지스틱 회귀 분석 공부 및 pfam 데이터 이용해서 해보기 - 운동 시작

4/7

패턴인식, 바이오인포메틱스 수업 및 복습 로지스틱회귀 공부

Dear sukdo

위키홈페이지 부분을 잘 읽어보시기 바랍니다. 이곳은 위키위키를 연습하는 곳이 아닙니다. 개인 페이지는 이곳 한 페이지로 충분합니다. --WkPark

페이지가 지워져서 혹시 놀라셨나요? 이곳은 커뮤니티 위키입니다. 개인 위키와는 다른 곳입니다. 자신의 아이디와 동일한 이름을 가지는 위키홈페이지하나로도 자신만의 페이지는 충분합니다. 이곳에서 연습하시기 바라고요. KLDP 위키는 리눅스 오픈소스 커뮤니티 위키이므로 이것과 관련된 이야기가 올라오기를 기대합니다. 다른 개인적인 글은 이곳에 쓰시기를 바라겠습니다. 연구실 다른 분들에게도 말씀해주시길. --WkPark



sponsored by andamiro
sponsored by cdnetworks
sponsored by HP

Valid XHTML 1.0! Valid CSS! powered by MoniWiki
last modified 2008-04-10 01:44:37
Processing time 0.0055 sec