클러스터를 위한 소프트웨어를 크게 3가지로 나눈다면 클러스터에 사용될 OS, 클러스터를 구축하는데 필요 한 Middleware, 마지막으로 클러스터를 구성한후 사용할 프로그램으로 나눌수 있다. 다음은 이들에 대한 간단한 조언이다.
가장 널리 사용되는 OS 로는 역시 리눅스를 들수 있다. 현재 리눅스를 이용하여 클러스터를 구축하기 위한 많은 기술문서와 라이브러리, 모니터링 툴, 큐잉시스템 등이 공개되어 있으며 심지어는 클러스터링 을 위한 커널이미지, 배포판 등도 나와 있다. 물론 리눅스뿐 아니라 UNIX 와 MS 의 Window 로도 클러스터를 구축할수 있다.
여기서 말하는 미들웨어란 병렬 라이브러리, 모니터링 툴, 큐잉시스템 등 클러스터 관련 소프트웨어를 지칭한다. 먼저 병렬 라이브러리는 무수히 많이 있으며 이들중 원하는 라이브러리를 하나 또는 여러 개 선택해서 설치할수 있다. 모니터링 툴과 큐잉시스템 역시 다수가 공개되어 있으며 상용툴들도 나와 있다. 이들에 대한 자세한 정보는 Reference Sites 에 나와 있는 각 소프트웨어의 홈페이지를 참고하기 바란다.
기존의 워크스테이션 에서 돌아가고 있는 프로그램을 클러스터 에서 실행한다고 해서 성능이 좋아지는 것은 아니다. 클러스터를 비롯한 병렬처리 컴퓨터는 병렬화 된 코드를 요구한다. 즉 시리얼 프로그램을 병렬화 한후 이를 클러스터에서 실행해야 한다. C, C++, Fortran 으로 만든 프로그램은 전통적으로 병렬화가 가능하다.