Linux에서 돌아가는 Alpha 기반 머신의 능력은 실제로는 내부의 어려운 세부사항에 대한 정보를 갖는 여러분의 능력에 의해서만 제한되어 있다. E66, EB64+ 그리고 EB164 보드를 위한 Linux 포트(port) 때문에, 21066, 21064/APECS나 21164/ALCOR 기반의 모든 시스템은 약간의 수정으로 Linux를 돌릴수 있다. 이들 마더 보드사이에 있는 가장 큰 차이는 인터럽트를 라우트하는 방법이다. 여기에 인터럽트의 3가지 자원이 있다.
on-board devices
PCI devices
ISA devices
Intel System I/O 브릿지(SIO)를 사용하는 모든 시스템은 PCI와 ISA()사이의 브릿지처럼 작동한다. SIO는 전통적인 daisy-chained 8259 pair를 포함한다.
몇몇 시스템(e.g., Noname)은 SIO를 통해 CPU로 인터럽트 모두를 라우팅한다. 몇몇 시스템은 분리된 인터럽트 콘트롤러를 가지고 있으며 모든 PCI 인터럽트와 SIO 인터럽트(8259 output)를 라우팅하며 SIO를 통해 모든 ISA 인터럽트를 라우팅한다.
시스템 사이에 포함되어 있는 다른 차이점들:
얼마나 많은 슬롯을 가지고 있는가.
가지고 있는 보드내 PCI 장치는 무엇인가.
Flash 인가, EPROM 인가.